Il 19 aprile 2000 su iniziativa del più importante gruppo assicurativo italiano, le Assicurazioni GENERALI, è stata costituita la PROTOS Società Organismo di Attestazione S.p.A. che, per la rilevanza e la complessità dell'attività da svolgersi aveva necessità di dotarsi di specifico know-how nel settore dell'auditing, individuato nella KPMG - uno dei cinque maggiori networks mondiale della consulenza e certificazione - e nella PROTOS Società di Controlli Tecnici e Finanziari operante da oltre 15 anni nel campo del project monitoring. L'affidabilità ed i criteri di imparzialità e rigore con cui gli azionisti fondatori intesero connotare il nuovo organismo attraverso una Presidenza di elevato standing, cui fu chiamato il Prof. Gianfranco Imperatori, ed una Direzione Generale individuata al di fuori del sistema dell'Albo Nazionale Costruttori, destarono l'interesse del pià importante gruppo bancario italiano BANCA INTESA e di altre importanti istituzioni del comparto assicurativo (gruppo UNIPOL e SWISS RE Italia) nonchè dell'ASSISTAL e dell'UPI Unione Province Italiane, entrati tutti a far parte della compagine sociale. PROTOS SOA è stata autorizzata dall'Autorità per la Vigilanza sui Lavori Pubblici all'esercizio dell'attività di attestazione in data 9 novembre 2000 ed è stata il primo organismo a dotarsi di un sistema di qualità UNI EN ISO 9001 certificato dal DNV. Nel 2002 la Società ha inoltre incorporato la SIOA S.p.A. di Roma, anch'essa nata su iniziativa di alcuni importanti gruppi del credito e delle assicurazioni e nel 2005 la SOA ADRIATICA S.p.A già operante a Ravenna per assicurare una stabile presenza nell'area del centro-nord.
Dal 2007 la società ha avviato un programma di decentramento con l'apertura di sedi e punti di riferimento regionali, ultime quelle di Milano, Bari, Cagliari e Chieti, al fine di offrire e migliorare il proprio servizio alle Imprese ed essere più vicina ai suoi Clienti. Vanta oggi un organico stabile di circa 30 addetti e la presenza capillare sul territorio di tecnici esterni che assicurano contatti diretti e personali alle imprese. Un team di professionisti altamente specializzati ed aggiornati è in grado di offrire i necessari chiarimenti ed approfondimenti per una semplificazione e celerità del processo di attestazione. Consapevole dell'importanza dell'approccio etico e morale la Società si è dotata di un codice etico e di condotta che disciplina l'insieme dei valori che PROTOS SOA riconosce, accetta e condivide, a tutti i livelli, nello svolgimento dell'attività di qualificazione delle imprese.
PROTOS SOA è associata, sin dalla fondazione, ad Unionsoa l'associazione nazionale degli organismi di attestazione.
Sono circa 2.300 le imprese, tra cui i più importanti gruppi italiani ed esteri, che hanno scelto PROTOS SOA per la loro qualificazione ed alla fine del 2008 sono poco meno di 10.000 le attestazioni rilasciate.
